Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CUL1Q13616 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL1Q13616 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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