Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRQ13535 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms