Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms