Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms