Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ITGB3BPQ13352 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms