Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATMQ13315 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATMQ13315 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ATMQ13315 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
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