Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGDRQ13258 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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