Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.8 ms