Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
STRN3Q13033 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.8 ms