Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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