Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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