Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
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PTPRBP23467 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
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PTPRBP23467 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
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PTPRBP23467 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
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PTPRBP23467 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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PTPRBP23467 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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PTPRBP23467 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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