Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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