Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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