Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZBED9Q6R2W3 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED9Q6R2W3 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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