Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC124944.3-204ENST00000641191 150 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms