Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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USF2Q15853 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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USF2Q15853 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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USF2Q15853 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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USF2Q15853 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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USF2Q15853 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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