Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD8Q15843 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms