Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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