Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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