Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CHD4Q14839 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
CHD4Q14839 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD4Q14839 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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