Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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