Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms