Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CCINQ13939 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CCINQ13939 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CCINQ13939 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCINQ13939 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCINQ13939 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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