Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ATP1A4Q13733 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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