Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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