Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms