Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATMQ13315 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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