Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms