Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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