Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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GRIK2Q13002 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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