Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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FOXD4Q12950 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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FOXD4Q12950 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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FOXD4Q12950 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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