Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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