Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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