Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM35Q9UPQ4 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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