Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms