Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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