Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMG1Q96Q15 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMG1Q96Q15 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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