Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPROQ16827 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPROQ16827 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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