Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms