Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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