Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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