Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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