Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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