Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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