Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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