Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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GPNMBQ14956 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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GPNMBQ14956 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GPNMBQ14956 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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