Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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SMCO1Q147U7 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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