Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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DDX39BQ13838 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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