Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SPTAN1Q13813 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms